Het station in Meppel werd op 1 oktober 1867 in gebruik genomen als eerste treinstation in Drenthe. Het was onderdeel van de spoorlijn tussen Zwolle en Meppel, die later werd voortgezet naar Leeuwarden, Assen en Groningen.
Station derde klasse
Het gebouw werd gebouwd naar standaardontwerp van de Staatsspoorwegen. Het is een station van de vernieuwde uitvoering derde klasse. Van dit type station bestaat naast Meppel nog slechts één ander voorbeeld, namelijk in Zuidbroek (gebouwd in 1865). De overige tien zijn inmiddels afgebroken.
Het station kent 2 perrons, een (niet verhoogd) perron langs het stationsgebouw en een eilandperron, echter worden alleen de sporen aan het eilandperron gebruikt door de treinen. Tevens ligt er ook nog een emplacement, wat niet meer gebruikt wordt.
Verbinding met andere provincies
In 1868 kwam ook de verbinding Meppel – Heerenveen – Leeuwarden gereed, waarmee de Friese hoofdstad een rechtstreekse spoorverbinding met de rest van het land kreeg. In 1870 kwam ook de verbinding Meppel – Hoogeveen – Assen – Groningen gereed, waarmee zowel Drenthe, Groningen als Friesland via Meppel met Zwolle waren verbonden. Sindsdien zijn deze verbindingen de belangrijkste schakels geweest in het treinverkeer van en naar het noorden van Nederland. Op 1 mei 1952 zijn beide verbindingen geëlektrificeerd.